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BIOGER

BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes

Contrats et collaborations

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La nature de nos contrats de recherche est diverse : projets européens H2020ANRCTPS-CasdarGNIS-FSOVMétaprogrammes INRA. Depuis 2011 notre équipe a participé à plus de 30 projets internationaux et nationaux, dont 5 projets européens ("Pure", "PlantFoodSec", "Whealbi", "Emphasis", "RustWatch") et 4 projets ANR ("BreedWheat", "Gester", "Gandalf", "Wheatamix"). Notre participation à des projets appliqués (8 CTPS-Casdar ou GNIS-FSOV) est récurrente, illustrant les liens étroits entre nos activités de recherche et les attentes de certaines entreprises (sélectionneurs, à l'exemple de Florimond DesprezRAGT 2NLimagrainSyngentaLemaire-DeffontainesBASF) et instituts techniques (ARVALIS-Institut du VégétalGEVES) de la filière céréalière. Notre équipe a par ailleurs bénéficié de financements thématiques INRA dans le cadre des Métaprogrammes SMaCH et ACCAF.

Nous entretenons des collaborations historiques fortes avec plusieurs unités de recherche INRA : principalement EcoSys (Grignon) avec plusieurs projets doctoraux co-encadrés, BiOSP (Avignon) et MaIAGE (Jouy), mais aussi GDEC (Clermont-Ferrand), IaM (Nancy) et IGEPP (Rennes) sur des projets et réseaux spécifiques. Nous développons également des collaborations internationales, par exemple avec l'Univeristé d'Aarhus et l'INAT de Tunis pour l'analyse des populations de Puccinia striiformis, l'Université de Wageningen pour l'analyse de la résistance quantitative hôte et non-hôte contre les rouilles, l'ETH de Zürich et l'Université de Neuchâtel pour l'épidémiologie et l'adaptation hôte-pathogène des populations de Zymoseptoria triticiRothamsted Research pour l'épidémiologie théorique, et Imperial College et Agroinnova-Université de Turin pour la biosécurité des cultures et l'analyse du risque phytosanitaire.

Nom du Projet

Sujet

Chef de projet / Principaux Collaborateurs

Projets Internationaux

"RustFight" (Denmark, 2012-2017)

Relever les nouveaux défis posés par les champignons parasites responsables des rouilles des plantes cultivées

Claude de Vallaveille-Pope / Mogens Hovmøller (Aarhus University, DK)

"PHC Utique" France-Tunisia" (2012-2017)

Adaptation des souches invasives de Puccinia striiformis (rouille jaune) sur blé en Méditerranée et dans les zones tempérées

Claude de Vallaveille-Pope / Bochra Bahri (INAT, Tunis, TUN)

Projets Européens

"Pure" (FP7 EU KBBE, 2011-2014)

Réduction de l'utilisation des pesticides et des risques dans les systèmes agricoles européens grâce à la lutte intégrée contre les ravageurs des cultures

Claude de Vallaveille-Pope

"PlantFoodSec" (FP7 EU, 2011-2015)

Biosécurité végétale et alimentaire

Frédéric Suffert / Maria Lodovica Gullino (Agroinnova-Universita di Torino, IT), John Mumford (Imperial College, London, UK), Marc Barbier (INRA LISIS, Marne-la-Vallée, FR), Valérie Laval (BIOGER EPLM)

"Whealbi" (FP7 EU KBBE, 2014-2018)

Ressources du blé et de l'orge pour l'amélioration de la sélection

Thierry Marcel / Gilles Charmet (INRA GDEC, Clermont-Ferrand, FR)

"Emphasis" (H2020 EU, 2015-2019)

Gestion efficace des ravageurs et des espèces exotiques nuisibles : vers des solutions intégrées

Frédéric Suffert / Maria Lodovica Gullino (Agroinnova-Universita di Torino, IT), Martin Ward (EPPO, Paris, FR), Matthieu Barret (INRA IRHS, Angers, FR), Valérie Laval, Mylène Balsesdent (BIOGER EPLM)

+ Alexei Mikaberidze, Peteri Karisto (ETH, Zürich, CHE)

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"RustWatch" (H2020 EU, 2018-2022)

Un système européen d'alerte rapide pour les rouilles du blé

Henriette Goyeau / Mogens Hovmøller (Aarhus University, DK)

Projets ANR

"BreedWheat" (ANR Biotechnologies, 2011-2019)

Développer de nouvelles variétés de blé pour une agriculture durable : une approche intégrée de la génomique à la sélection

Thierry Marcel

"Gester" (ANR, 2012-2015)

Évaluation de scénarios pour la gestion territoriale des résistances variétales dans une perspective de durabilité

Henriette Goyeau, Christian Lannou / François Coléno (INRA SAD-APT, Grignon, FR)

"Gandalf" (ANR Bioadapt, 2013-2017)

Génomique et adaptation de traits de vie des champignons impliqués dans les interactions avec leurs plantes hôtes

Thierry Marcel

"Wheatamix" (ANR, 2013-2018)

Accroître la diversité génétique du blé à l'échelle de la parcelle pour renforcer la multifonctionnalité et la durabilité de la production dans le Bassin parisien

Claude de Vallaveille-Pope / Jérome Enjalbert (INRA GQE, Le Moulon, FR), Sébastien Saint-Jean (INRA-AgroParisTech EcoSys, Grignon, FR)

Projets LabEx

"SeptoVar" (LabEx BASC, 2014-2016)

Réponses de populations locales de Zymoseptoria tritici aux variations spatiales de deux facteurs majeurs - température et résistance variétale - et inférence de leur potentiel d'adaptation aux changements globaux

Frédéric Suffert, Anne-Lise Boixel / Michaël Chelle (INRA EcoSys, Grignon, FR), Sylvain Pincebourde (CRNS IRBI, Tours, FR)

"ApiSmal" (LabEx BASC, 2016-2019)

Agro-écologie et instruments de politiques publiques pour des paysages agricoles multifonctionnels et durables

Frédéric Suffert, Florence Carpentier / Vincent Martinet (INRA EcoPub, Grignon, FR)

Projets Casdar-FSOV

"Associations Variétales" (CTPS-Casdar, 2011-2013)

Concevoir des associations variétales de blé pour réduire la progression épidémique de la septoriose : approches théorique et expérimentale

Claude de Vallaveille-Pope / Sébastien Saint-Jean (INRA-AgroParisTech EcoSys, Grignon, FR)

"SeptoDur" (CTPS-Casdar, 2013-2015)

Contribution à la durabilité de la lutte génétique et chimique contre la septoriose du blé dur par la caractérisation des populations du complexe pathogène

Thierry Marcel / Romain Valade (ARVALIS-Institut du Végétal, Grignon, FR)

"Duromal" (CTPS-Casdar, 2014-2017)

Résistance durable aux maladies foliaires du blé dur

Henriette Goyeau / GIE Blé DurRomain Valade (ARVALIS-Institut du Végétal, Grignon, FR)

"SeptoLin" (CTPS-Casdar, 2015-2018)

Étude épidémiologique du "Pasmo" appliquée à la caractérisation de la résistance variétale à Septoria linicola et ses effets sur le rendement et la qualité du lin

Frédéric Suffert, Lilian Gout / Romain Valade (ARVALIS-Institut du Végétal, Grignon, FR), Annette Penaud (Terres Inovia, Grignon, FR)

"Rouille Brune" (GNIS-FSOV, 2012-2015)

Résistance durable à la rouille brune du blé : génération d'un panel de QTLs cartographiés et diversifiés

Henriette Goyeau

"Rouille Jaune I" (GNIS-FSOV, 2012-2015)

Stabilité de la résistance du blé à la rouille jaune : complémentarité entre recherche, sélection et développement

Claude de Vallaveille-Pope

"Rouille Jaune II" (GNIS-FSOV, 2016-2019)

Recherche de sources de résistance durable à la rouille jaune dans le blé dur et le triticale

Claude de Vallaveille-Pope

"MaBrune" (GNIS-FSOV, 2016-2019)

Identification de marqueurs diagnostiques de la résistance du blé tendre à la rouille brune

Henriette Goyeau

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"Persist" (GNIS-FSOV, 2018-2020)

Préserver et améliorer l'efficacité des gènes de résistance à la septoriose : le cas du gène Stb16q

Lilian Gout, Frédéric Suffert / Cyrille Saintenac (INRA GDEC, Clermont-Ferrand, FR), Gert Kema (WUR, Wageningen, NL), Marc-Henri Lebrun (BIOGER EGIP)

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"DivR" (GNIS-FSOV, 2018-2020)

Outils moléculaires pour la sélection d'une résistance diversifiée et efficace contre la septoriose du blé

Thierry Marcel / Daniel Croll (Université de Neuchâtel, CHE), Cyrille Saintenac (INRA GDEC, Clermont-Ferrand, FR)

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"TritiRB" (GNIS-FSOV, 2018-2020)

Caractérisation des sources durables de résistance à la rouille brune du triticale

Henriette Goyeau / GIE Triticale

Autres financements nationaux

"Tritisafe" (EcophytoPIC, DGAL, 2014-2017)

Caractérisation des champignons pathogènes responsables des nécroses foliaires du triticale et création d’idéotypes multi-résistants pour des semences de qualité et une agriculture durable

GIE Triticale (FR)

Soutiens de Fondations

"LU" (ANRT, Biodiversité-LU, 2011-2014)

Valoriser la biodiversité spécifique et variétale à l’échelle de la parcelle agricole pour limiter l’utilisation des intrants chimiques et leurs impacts

Claude de Vallaveille-Pope / Sébastien Saint-Jean (INRA-AgroParisTech EcoSys, Grignon, FR)

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"BCMicrobiome" (Biocontrol Consortium, 2018-2021)

Apprendre des réseaux microbiens à partir de données de métabarcodage : application à la lutte biologique

Frédéric Suffert / Corinne Vacher (INRA BIOGECO, Bordeaux, FR) Valérie Laval (BIOGER EPLM)

Projets INRA

"Blade" (IVD program, 2016-2020)

Blés pour une agriculture durable et écologique

Thierry Marcel

"Fondu" (MP SMaCH, 2013-2017)

Stratégies territoriales d’utilisation durable des antifongiques

Florence Carpentier / Anne-Sophie Walker (BIOGER AMAR)

"MoGeR" (MP SMaCH, 2017-2019)

Des connaissances à la modélisation : vers un outil de simulation convivial pour tester des scénarios de gestion des résistances variétales dans le cas du phoma du colza

Florence Carpentier / Mylène Balesdent (BIOGER EPLM)

"Espace" (MP SMaCH, 2017-2021)

Estimer les effets des variables paysagères sur les bioagresseurs et auxiliaires des cultures

Florence Caprentier

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"Educ.Net" (MP SMaCH, 2018-2020)

Maladies végétales émergentes sous l'effet du changement climatique - Un réseau de recherche pour évaluer les menaces mondiales qui pèsent sur le blé et s'y adapter

Frédéric Suffert, Anne-Lise Boixel / Serge Savary (INRA AGIR, Castanet Tolosan, FR)

"Clif" (MP ACCAF, 2013-2016)

Impact du changement climatique sur les pathosystèmes fongiques : estimation des changements de maladies à l'aide de modèles et d'indicateurs, conception de stratégies d'adaptation et comblement de lacunes dans les connaissances clés

Claude de Vallaveille-Pope / Laurent Huber, Marie-Odile Bancal (INRA-AgroParisTech EcoSys, Grignon, FR), Marie Launay (INRA AgroClim, Avignon, FR)

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"Stratageme" (SPE project, 2018-2020)

Stratégies de gestion durable des fongicides : contribution de l'évolution expérimentale

Florence Carpentier / Anne-Sophie Walker (BIOGER AMAR)

"Apôgé" (SPE project, 2017-2019)

Adaptation de champignons phytopathogènes à des peuplements hôtes génétiquement hétérogènes

Thierry Marcel