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ATIPICAL est porté par l'équipe EPLM (Effecteurs et pathogénèse chez Leptospaheria maculans) de l'unité BIOGER

Ce projet issu de l'appel à projet CASDAR 2018 a débuté en janvier 2019 pour une durée de 36 mois.

Les résultats attendus sont :

Pour le Phoma du colza :

(i) Connaissance réactualisée des virulences par région. Cette information sera communiquée à l’ensemble de la profession via un article de vulgarisation, le site web (www.terresinovia.fr/) et les services de communication de Terres Inovia, et une information auprès de la section Colza du CTPS.

(ii) Outil moléculaire pour estimer les fréquences de virulences au champ (publication scientifique) qui pourra ainsi être utilisé par toute personne souhaitant caractériser un site expérimental ou une région de culture du colza.

(iii) Réactualisation de la connaissance sur la diversité allélique pour les différents gènes d’avirulence étudiés (Publication scientifique).

Pour l’ensemble des maladies aériennes du colza :

(i) une collection de souches de C. concentricum représentatives des populations françaises actuelles

(ii) une collection caractérisée de souches (environ 100) de plusieurs espèces de champignons pathogènes du colza. La description de cette collection (notamment les séquences de gènes barcode) sera disponible via la base R-Syst (https://www6.inra.fr/r-syst). Ces souches pourront être mises à disposition de la profession.

(iii) une base de données de photos de symptômes foliaires identifiés, pouvant servir à développer ultérieurement un outil d’aide à l’identification par l’image. (iv) une compilation des informations bibliographiques et/ou techniques pertinentes sur chaque espèce, permettant à l’ensemble des acteurs de maitriser chaque pathosystème à des fins de projets ultérieurs de recherche, ou de développement de variétés résistantes ou tolérantes. (www.terresinovia.fr/, recueil édité).