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Recherches
Je suis épidémiologiste dans le domaine de la santé des cultures. Je m'intéresse à la gestion durable des résistances génétiques aux maladies des plantes. Je contribue également à des travaux sur l'adaptation des parasites à leur plante hôte, sur les traits quantitatifs liés à cette adaptation, sur la résistance quantitative de l'hôte ou sur la dispersion et le cycle de vie des champignons parasites. Dans ces projets, j'associe modélisation et expérimentation pour explorer et comprendre des systèmes qui sont assez complexes tout en acquérant des données et des connaissances de terrain.

Applications
Le principal enjeu appliqué de mon travail est de réduire la dépendance de l'agriculture aux pesticides en valorisant au mieux la résistance génétique des plantes cultivées. Une première voie est d'améliorer la manière d'utiliser les variétés résistantes dans une région agricole (dans le temps et dans l'espace). Une seconde approche est de développer des stratégies d'utilisation des fongicides moins consomatrices et susceptibles de ralentir l'appartion de formes résistantes chez les parasites.
On peut penser qu'un deploiement raisonné des variétés résistantes associée à une bonne gestion des applications de fongicides permettra de diminuer significativement les quantités de produits appliquées sur les cultures sans réduire la productivité de celles-ci. Jusqu'où pourra-t-on aller dans cette réduction ? C'est encore difficile à dire...

Principales collaborations
L'équipe des mathématiciens INRA MIA de Jouy en Josas et en particulier Hervé Monod, Olivier David, Suzanne Touzeau, pour les travaux sur la gestion durable des résistances génétiques.
Frank van den Bosch et Femke van den Berg, de Rothamsted Research, Royaume-Uni, pour les travaux sur la gestion durable des résistances génétiques et l'adaptation des parasites à leur hôte.
Marie-Hélène Jeuffroy, Frédérique Angevin, François Coléno et les autres partenaires du projet Gester.
Florence Forget et l'équipe INRA MycSa de Bordeaux pour les travaux sur la fusariose du blé.
Mes collègues du  CIRAD , Didier Tharreau et Jean Carlier, qui m'emmènent vers des parasites plus exotiques.
Samuel Soubeyrand (INRA Avignon), un dieu des Stats.

Partenariat
Les principaux partenaires de mes projets sont Arvalis - Institut du végétal, Bayer CropScience et les groupement français de sélectionneurs de blé (Club des Cinq et CETAC). Ces partenaires contribuent au financement de nos travaux mais nous ouvrent aussi l'accès à des jeux de données très utiles. Ils nous apportent également une précieuse expertise de terrain.

Thèses supervisées récemment

• David Blanchard (en cours). Modélisation du risque sanitaire en grande culture à l'échelle régionale par une approche bayésienne. AgroParisTech (ABIES). Co-encadrement avec H. Monod, INRA Jouy. Thèse cofinancée par l'INRA (métaprogramme SMaCH) et Arvalis.
• Dorothée Siou (2013). Développement épidémique de la fusariose du blé et production de mycotoxines. Université Paris XI (Sciences du Végétal). Financement Cifre et Bayer CropScience. [pdf]
• Gustavo Azzimonti (2012). Diversification de la résistance quantitative à la rouille brune du blé à partir de la caractérisation des composantes de la résistance. AgroParisTech (ABIES). Co-encadrement avec H. Goyeau et I. Sache. Financement Cifre, Florimond Desprez et GNIS. [pdf]
• Julien Papaïx (2011). Structure du paysage agricole et risque épidémique, une approche démo-génétique. AgroParisTech (ABIES). Co-encadrement avec H. Monod, INRA Jouy. Thèse financée par l'INRA (ASC). [pdf]
• Adeline Picot (2010). Modulation de la production des fumonisines sur épis de maïs : influence des composantes physiologiques et biochimiques du grain et des évènements de contamination multiple. Université Paris XI (Sciences du Végétal). Co-encadrement avec F. Forget, INRA Bordeaux. Financement Cifre et Arvalis. [pdf]
• Bénédicte Pariaud (2008). Agressivité de Puccinia triticina (agent de la rouille brune du blé) et son adaptation à l'hôte. Université Paris XI (Sciences du Végétal). Financée par une bourse de l'école doctorale et un contrat FSOV. [pdf] 

Publications récentes

• Lannou C, Soubeyrand S. 2013. Measure of Life-cycle Traits of a Biotrophic Pathogen. in Exercises in Plant Disease Epidemiology, second edition, Stevenson KL, Jeger MJ eds. APS Press, The American Phytopathological Society, St. Paul, USA.
• Suffert F, Sache I, Lannou C. 2013 Assessment of quantitative traits of aggressiveness in Mycosphaerella graminicola on adult wheat plants. Plant Pathology doi: 10.1111/ppa.12050. [pdf]
• Papaïx J, David O, Lannou C, Monod H. 2013. Dynamics of adaptation in spatially heterogeneous metapopulations. PLoS ONE 8(2): e54697. [pdf]
• Lannou C. 2012. Variation and Selection of Quantitative Traits in Plant Pathogens. Annual Review of Phytopathology 50:319-338. [pdf]
• Pariaud B, van den Berg F, van den Bosch F, Powers SJ, Kaltz O, Lannou C. 2012. Shared influence of pathogen and host genetics on a trade-off between latent period and spore production capacity in the wheat pathogen, Puccinia triticina. Evolutionnary Applications 6:303-312 [pdf]
• van den Berg F, Lannou C, Gaucel S, Gilligan CA, van den Bosch F. 2012. High levels of auto-infection inplant pathogens favour short latent periods: a theoretical approach. Evolutionary Ecology 27:409-428 [pdf]
• Azzimonti G, Lannou C, Sache I, Goyeau H. 2012. Components of quantitative resistance to leaf rust in wheat cultivars: diversity, variability and specificity. Plant Pathology doi: 10.1111/ppa.12029. [pdf]
• Picot A, Hourcade-Marcolla D, Barreau C, Pinson-Gadais L, Caron D, Richard-Forget F, Lannou C. 2012. Interactions between Fusarium verticillioides and Fusarium graminearum in corn ears and consequences for fungal development and mycotoxin accumulation. Plant Pathology 61:140-151. [pdf]
• Goyeau H, Berder J, Czerepak C, Gautier A, Lanen C, Lannou C. 2012. Low diversity and quick evolution in the population of Puccinia triticina causing durum wheat leaf rust in France from 1999 to 2009, as revealed by an adapted differential set. Plant Pathology 61:761-772. [pdf]
• Caubel J, Launay M, Lannou C, Brisson N. 2012 Generic response functions for simulating climate-based processes in crop pathosystem models. Ecological Modeling 242:92-104.
• Raboin L-M, Ramanantsoanirin A, Dusserre J, Razasolofonanahary F, Tharreau D, Lannou C, Sester M. 2012. Two-component cultivar mixtures reduced rice blast epidemics in an upland agrosystem. Plant Pathology 61:1103-1111 [pdf]
• Pariaud B, Goyeau H, Halkett F, Robert C, Lannou C. 2012. Variation in aggressiveness is detected among Puccinia triticina isolates of same pathotype and clonal lineage. European Journal of Plant Pathology 134:733-743. [pdf]
• Goyeau H, Lannou C. 2011. Specific resistance to leaf rust expressed at the seedling stage in cultivars grown in France from 1983 to 2007. Euphytica 178:45-62. [pdf]
• Suffert F, Sache I, Lannou C. 2011. Early stages of septoria tritici blotch epidemics of winter wheat: build-up, overseasoning, and release of primary inoculum. Plant Pathology 60:166-177. [pdf]
• Papaïx J, Goyeau H, Du Cheyron P, Monod H, Lannou C. 2011. Influence of cultivated landscape composition on variety resistance: an assessment based on wheat leaf rust epidemics. New Phytologist 191:1095-1107. [pdf]
• Picot A, Barreau C, Pinson-Galais L, Piraux F, Caron D, Lannou C, Richard-Forget F. 2011. The dent stage of maize kernels is the most conducive for fumonisin biosynthesis under field conditions. Applied and Environmental Microbiology 77:8382-8390. [pdf]
• van den Berg F, Bacaer N, Metz JAJ, Lannou C, van den Bosch, F. 2010. Periodic host absence can select for higher or lower parasite transmission rates. Evolutionary Ecology 25:121-137. [pdf]
• Picot A, Barreau C, Pinson-Gadais L, Caron D, Lannou C, Richard-Forget F. 2010. Factors of the Fusarium verticillioides-maize environment modulating fumonisin production. Critical Reviews in Microbiology 36:221-231. [pdf]
• Pariaud B, Ravigne V, Halkett F, Goyeau H, Carlier J, Lannou C. 2009. Aggressiveness and its role in the adaptation of plant pathogens. Plant Pathology 58:409-424. [pdf]
• Pariaud B, Robert C, Goyeau H, Lannou C. 2009. Aggressiveness Components and Adaptation to a Host Cultivar in Wheat Leaf Rust. Phytopathology 99:869-878. [pdf]
• Frezal L, Robert C, Bancal M-O, Lannou C. 2009. Local dispersal of Puccinia triticina and wheat canopy structure. Phytopathology 99:1216-1224. [pdf]
• Lannou C, Soubeyrand S, Frezal L, Chadoeuf J. 2008. Autoinfection in leaf rust dispersal. New Phytologist 177:1001-1011. [pdf]
• Willocquet L, Aubertot JN, Lebard S, Robert C, Lannou C, Savary S. 2008. Simulating multiple pest damage in varying winter wheat production situations. Field Crops Research 107:12-28.

petites synthèses

• Lannou C. 2009. Les épidémies dans les systèmes agricole. Biofutur 28/296:40-45. [pdf]
• Ducrot C, Lannou C. 2011. Epidémiologie : Maîtriser la maladie de l'animal au végétal. La Jaune et la Rouge, Dec 2011:22-27. [pdf]
• Lannou C, Papaïx J, Monod H, Raboin L-M, Goyeau H. 2013. Gestion de la résistance aux maladies à l’échelle des territoires cultivés. Innovations Agronomiques 29:33-44

Cours

• Ecole des Hautes Etudes en Santé Publique (EHESP): agricultural practices and plant health: lessons from the past, strategies for the future [cours 2013]
• Formation EpiCasa: illustration de l'apport des mathématiques pour traiter une question en épidémiologie végétale [cours 2012]
• M1 Sciences du Végétal: introduction à l'épidémiologie végétale [cours 2013]
• M2 Sciences du Végétal: introduction à l'épidémiologie végétale [cours 2012]
• M2 Sciences du Végétal: gestion des résistances aux maladies des plantes [cours 2012]
• M2 DIPHE Montpellier: comment l'évolution des pratiques agricoles a modifié le risque sanitaire engendré par les parasites des plantes [cours 2012]
• UC3 AgroParisTech: gestion des résistances aux maladies des plantes [cours 2012]