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ECOSYS (et ses composants EGC et PESSAC) est membre fondateur de la Fédération de recherche CNRS / UPMC de la Fédération Ile-de-France pour la Recherche Environnementale (FIRE - FR 3020, 2007-2017, en cours de renouvellement). Cette fédération, composée de 18 unités en région parisienne, a pour objectif de promouvoir la recherche interdisciplinaire dans le domaine des sciences de l'environnement. Son projet fédérateur concerne principalement des projets de recherche sur les surfaces continentales liées aux activités humaines (bassins versants et réseaux hydrographiques, parcelles et forêts agricoles, petites régions agricoles, paysages urbains et ruraux) et leurs interfaces avec les eaux souterraines sous-jacentes, les zones côtières et l'atmosphère. ECOSYS est impliqué dans l'équipe de direction (Sabine Houot). La FIRE a un budget de financement réduit mais a néanmoins pu financer des bourses de stage (M2), l’achat d’équipements partagés (stations météo, sondes multiparamètres pour mesurer la qualité de l’eau, sondes de caractérisation des sols NIRS, sondes X pour la détermination de divers éléments du sol, analyseurs de gaz de terrain) et l’équipement de piézomètres sur un site emblématique et fédérateur: le bassin versant d'Orgeval. Ces fonds ont également été utilisés pour préparer des projets à grande échelle sur des thèmes liés à la  FIRE. C'est le cas du projet ANR ESCAPADE (Evaluation des scénarios de la cascade d'azote en paysages agricoles et modélisation territoriale), piloté par Jean-Louis Drouet (ECOSYS), impliquant un consortium de laboratoires, appartenant pour la plupart à la FIRE.