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Les modèles décrivant le cycle du carbone et de l'azote dans les sols (RothC, Century, CERES…) permettent d’évaluer l’effet des propriétés du sol, du climat et des pratiques agricoles sur des émissions de GES mais ils ignorent les processus microscopiques du sol. Afin que ces modèles fournissent des prévisions plus précises et robustes, la représentation mécaniste des processus à petite échelle se révèle essentielle

Le projet Soilµ3D – Propriétés émergentes des fonctions microbiennes dans les sols : Identification de descripteurs spatiaux de la structure du sol à partir de modélisations 3D à l'échelle des habitats microbiens, a pour ambition d’utiliser les modèles de simulation de la dégradation microbienne de la matière organique à l'échelle des micro-habitats à l'aide d’images 3D du sol pour porter les hétérogénéités identifiées à l'échelle des micro-habitats aux échelles du profil de sol.

Coordonné par Patricia Garnier, UMR Écologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (Inra, AgroParisTech), Soilµ3D a été sélectionné dans le cadre de l’appel à projets générique - Gestion sobre des ressources et adaptation au changement climatique de l’Agence nationale de la recherche. Les résultats ont été publiés le 24 juillet 2015.