Exposés_2014

Colloque 2014 - Exposés

Programme et présentations du colloque 2014 à Evry

Vous trouverez le cas échéant dans le programme ci-dessous un lien pour télécharger les présentations pour lesquelles les auteur(e)s ont émis un avis favorable pour leur diffusion.
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Lundi 23 Juin

 

13:00

Accueil des participants au CEA-IG/CNG, salle de conférence Bat G2

 

13:30

Ouverture du Colloque

Dominique Brunel,organisateurs du colloque
Jean-François Deleuze, Directeur du CNG

 

Session I – Génotypage et séquençage haut-débit : technologies et applications

Marie-Christine LE PASLIER

14:00

Intérêts d’approches génomiques complémentaires pour l’analyse de la diversité génétique fonctionnelle de populations naturelles de Peuplier Noir

Catherine Bastien – INRA AGPF, Orléans

14:30

Recombinaison méiotique chez Arabidopsis thaliana: beaucoup de bruits  pour ....peu d'évènements

Christine Mézard – INRA IJPB, Versailles

15:00

Identification de loci candidats associés à la qualité du fruit chez la tomate, Solanum lycopersicum, par une approche de génétique d'association multilocus

Christopher Sauvage – INRA GAFL, Avignon

15:30

Genome-wide characterization of gene-families in resequencing projects - challenges and perspectives

Maharajah Ponnaiah– INRA EPGV, Evry

16:00

Discussion

 

16:30

Pause

 

17:00

Identification de gènes contrôlant des caractères majeurs chez la Tomate Micro-Tom par séquençage de mutants EMS

Lucie Fernandez – INRA BFP, Bordeaux

17:30

Génotypage et Séquençage haut-débit : quoi pour quoi?

Marie-Christine Le Paslier – INRA EPGV, Evry

18:00

Discussion

 

18:30

Discussion autour de l'apéritif

 

 

 

 

 

Mardi 24 Juin

 

8:40

Accueil des participants

 

 

Session II – Réflexions autour du Génotypage : hybridation vs séquençage

Patricia Faivre-Rampant

9:00

High-throughput genotyping in hexaploid wheat using the BreedWheat Axiom 420K SNP chip on Gentyane platform

Charles Poncet – INRA GDEC, Clermont Ferrand

9:30

Génotypage à haut débit à l'aide de puces AXIOM chez le Tournesol

Stéphane Muños – INRA LIPM, Toulouse

10:00

Génotypage Infinium : bilan EPGV

Aurélie Bérard – INRA EPGV, Evry

10:30

Table Ronde/Discussion

 

11:00

Pause

 

11:30

Génotypage (GBS) d’une large population multiparentale de sorgo de type BCNAM.

Angélique Berger – CIRAD, Montpellier

12:00

Genotyping By Sequencing by Cornell: a wonderful tool to explore genetic diversity within maize inbred lines collection provided that your imputation is well done

Stéphane Nicolas – INRA-GV, Moulon

12:30

Génotypage : autre approches

Marie-Christine Le Paslier – INRA EPGV, Evry

13:00

Table Ronde/Discussion

 

13:00

Déjeuner : les p'tits bocaux

 

 

Session I (suite) – Génotypage et séquençage haut-débit : technologies et applications

Marie-Christine LE PASLIER

14:00

Recent pea genomic resources for diversity and mapping studies in pea

Judith Burstin – INRA GEAPSI, Dijon

14:30

France Génomique, une infrastructure au service de la communauté

Pierre Le Ber –  CEA-IG/GENOSCOPE, Evry

15:00

Visite Genoscope et CNG

Robert Olaso –  CEA-IG/CNG, Evry
Arnaud Lemainque –  CEA-IG/GENOSCOPE, Evry

16:15

Pause

 

 

Session III – Analyse d'écosystèmes complexes par approches NGS

Dominique Brunel

16:30

TaraOcéans : du bateau au labo...de l'échantillonnage à la purification des acides nucléiques

Julie Poulain– CEA-IG/GENOSCOPE, Evry

17:00

TaraOcéans: des acides nucléiques aux séquences

Adriana Alberti – CEA-IG/GENOSCOPE, Evry

17:30

Metagénomique & métatranscriptomique eucaryote : stratégies, problématiques et exemples du projet TaraOcéans

Eric Pelletier – CEA-IG/GENOSCOPE, Evry

18:00

Oak infection by a major fungal pathogen (Erysiphe alphitoides) is associated with modified microbial communities

 Boris Jakuschkin  – UMR BIOGECO, Bordeaux

18:30

Discussion

 

19:30

Diner

 

 

 

 

 

Mercredi 25 Juin

 

8:40

Accueil des participants

 

9:00

Le séquençage massif pour caractériser la diversité microbienne des sols : standardisation et applications au sein de la plateforme GenoSol

Sébastien Terrat – INRA GenoSol, Dijon

9:30

Interactions Medicago truncatula – communautés microbiennes dans la rhizosphère : de l'amélioration de la valeur adaptative de l'hôte au pilotage des interactions dans un contexte agroécologique

Christophe Mougel – INRA IGEPP, Rennes

 

Session IV – Réflexions autour de l'assemblage de génome : hétérozygotie, polyploïdie, génome orphelin

 

10:00

Un détour vers le Génome Humain : Un point sur l’analyse de données d’Exome et Génome entier

Vincent Meyer – CEA-IG/CNG, Evry

10:30

Pause

 

11:00

Méthodes de séquençage et d'assemblage de génome eucaryote et complexité des génomes

Amin Madoui – CEA-IG/GENOSCOPE, Evry

11:30

Caractérisation de variations structurales intra-spécifiques par assemblage de novo de short-reads

JohannJoets– INRA-GV, Moulon

12:00

Apport du RNA-Seq dans l'etude des genomes orphelins

Véronique Brunaud – INRA-URGV, Evry
Etienne Delannoy – INRA-URGV, Evry

12:30

Table ronde Discussion

 

13:00

Fin du Colloque

 

13:00

Déjeuner : sandwich party

 

Documents à télécharger

Date de modification : 04 juillet 2023 | Date de création : 28 février 2017 | Rédaction : Elodie MARQUAND