En savoir plus

12:45

Accueil des participants au Bon Pasteur, salle Notre-Dame

13:30

Ouverture du Colloque

Marie-Christine Le Paslier – INRA EPGV, Evry

Session

I – Variants nucléotidiques

13:40

Polymorphisme de gènes candidats chez les rosiers sélectionnés au XIXe siècle en France

Jérémy Clotault – Université/INRA IRHS, Angers

14:00

Combining bulk segregant analysis with high-throughput sequencing to clone quantitative trait mutations: first results on early flowering F7p mutation

Stéphane Nicolas – INRA-GQE-Le Moulon, Gif sur Yvette

14:20

Découverte de variants (SNPs) et génotypage à partir de données RNA-seq chez le peuplier noir

Odile Rogier – INRA AGPF, Orléans

14:40

Apport du GBS chez les espèces fourragères

Philippe Barre – INRA URP3F, Lusignan

15:00

L'héritage napoléonien dans les populations de peuplier noir

Véronique Jorge – INRA AGPF, Orléans

15:20

Discussion

15:40

Pause

16:00

Densification du génotypage pour la sélection génomique chez le peuplier noir

Marie Pegard – INRA AGPF, Orléans

16:20

50K vs GBS vs 600K pour la détection de QTL par GWAS

Sandra Negro – AgroParisTech/INRA--GQE-Le Moulon, Gif sur Yvette

16:40

High-throughput genotyping in hexaploid wheat using the BreedWheat Axiom 420K SNP array

Jonathan Kitt – INRA GDEC, Clermont Ferrand

17:00

Génotypage SNP haut débit : retour d’expérience sur puces AXIOM 50k et 600k chez le tournesol

Nicolas Pouilly – INRA LIPM, Toulouse

17:15

Puce de génotypage Infinium multi-espèces vs mono-espèce : bilan

Aurélie Bérard – INRA EPGV, Evry

17:30

Seq vs puce: quels challenges aujourd'hui ?

Dominique Brunel/Patricia Faivre Rampant – INRA EPGV, Evry

17:40

Discussion

18:00

Clôture J1 - Temps libre

18:45

Autour de l'apéritif

19:30

Diner à l'Hostellerie

8:20

Accueil des participants

Session

II – Variants structuraux

8:30

CNV chez l’épicea : détections et conséquences évolutives

John MacKay – University of Oxford, UK

8:55

Deciphering the contribution of Present/Absent variants to genetic diversity and traits using a 100k maize high-throughput array

Clément Mabire – INRA--GQE-Le Moulon, Gif sur Yvette

9:15

Characterization of large structural variations using large insert size Illumina mate-pair resequencing data

Guillaume Martin – CIRAD, Montpellier

9:35

Genome-wide analysis of the maize FV2 inbred line Presence/Absence Variants and their implication in European maize genetic originality

Johann Joets – INRA--GQE-Le Moulon, Gif sur Yvette

9:55

Étude d'une famille de gènes R dans le genre Vitis par analyse de CNV

Guillaume Barnabe – INRA SVQV, Colmar

10:15

Discussion

10:35

Pause

Session

III – Epigénétique

10:55

Analyse du méthylome : retour d'expérience !

Stéphane Maury – LBLGC, Université, Orléans

11:15

Variation du méthylome entre lignées de maïs

Clémentine Vitte – CNRS-GQE-Le Moulon, Gif sur Yvette

Session

IV – Hors sentiers battus

11:35

Développement de ressources moléculaires chez l'espèce orpheline Lavandula angustifolia (lavande fine) pour la mise en place de nouvelles stratégies de sélection

Berline Fopa-Fomeju – INRA EPGV, Evry/Vegepolys, Angers

11:55

Le DNA barcoding : un outil à développer pour étudier les processus de pollinisation

Jean-Noël Galliot – INRA EPGV, Evry/UMRH Theix

12:15

Discussion

12:30

Déjeuner au self de l'Hostellerie

14:00

En route pour le centre INRA de Beaucouzé

Session

V – Découvertes angevines-IRHS

14:40

Présentation générale de l’IRHS (salle Authion, nouveau bâtiment)

Jean-Pierre Renou

15:00 

Visite bâtiment recherche : Plateau ANAN/IMAC (60 min),

Muriel Bahut

16 :00

Visite UE : collection Pommiers (30 min)– Rosiers (20 min)

Arnaud Guyader, Laurence Feugey

Fabrice Foucher, Tatiana Thouroude, Alix Pernet

17 :00

Visite INEM (45 min) Visite vente de pommes

R.Gardet, Jean-Pierre Renou

17:45

Clôture j2 - Temps libre

18:30

Proposition de promenade/découverte sur Angers - RDV face au Château

19:30

Dîner Festif à la Galerie David d'Angers

8:50

Accueil des participants

Session

VI – Ciblage génomique

9:00

RenSeq : méthodologie et application chez le Blé

Clémence Marchal – INRA IaM, Nancy/JIC, UK

9:20

Vers une meilleure compréhension des génomes végétaux : d’une organisation globale à une région ciblée

Céline Chantry-Darmon – INRA CNRGV, Toulouse

Session

VII – Séquence de génomes

9:40

Séquençage de génome en 2017-2018 / Oxford Nanopore Technology : Données et applications

Jean-Marc Aury – CEA-IG, Evry

10:10

Extraction ADN de haut poids moléculaire & SeQuel (PacBio)

Véronique Gautier– INRA Gentyane, Clermont Ferrand

10:30

 Discussion

10:50

Pause

11:20

The apple reference genome and epigenome

Etienne Bucher – INRA IRHS, Angers

11:40

Séquençage de novo du génome du tournesol

Stéphane Muños – INRA LIPM, Toulouse

12:00

Bread Wheat Whole Genome Sequence Assembly

Frederic Choulet – INRA GDEC, Clermont-Ferrand

12:20

Stratégie de séquençage et de génotypage SNP haut débit du génome hautement polyploïde de la canne à sucre

Olivier Garsmeur – CIRAD, Montpellier

12:40

 Discussion

13:00

Fin du Colloque

13:00

Paniers Pique-nique